Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RarbP22605 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RarbP22605 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RarbP22605 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RarbP22605 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RarbP22605 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RarbP22605 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RarbP22605 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RarbP22605 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RarbP22605 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RarbP22605 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RarbP22605 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RarbP22605 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RarbP22605 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RarbP22605 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RarbP22605 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RarbP22605 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RarbP22605 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RarbP22605 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RarbP22605 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RarbP22605 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RarbP22605 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RarbP22605 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RarbP22605 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RarbP22605 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RarbP22605 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RarbP22605 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RarbP22605 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RarbP22605 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RarbP22605 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RarbP22605 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RarbP22605 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RarbP22605 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RarbP22605 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RarbP22605 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RarbP22605 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RarbP22605 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RarbP22605 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RarbP22605 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RarbP22605 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RarbP22605 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RarbP22605 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RarbP22605 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RarbP22605 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RarbP22605 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RarbP22605 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RarbP22605 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RarbP22605 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RarbP22605 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RarbP22605 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RarbP22605 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RarbP22605 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RarbP22605 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RarbP22605 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RarbP22605 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RarbP22605 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RarbP22605 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RarbP22605 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RarbP22605 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RarbP22605 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RarbP22605 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RarbP22605 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RarbP22605 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RarbP22605 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RarbP22605 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RarbP22605 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RarbP22605 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RarbP22605 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RarbP22605 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RarbP22605 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RarbP22605 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RarbP22605 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RarbP22605 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RarbP22605 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RarbP22605 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RarbP22605 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RarbP22605 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RarbP22605 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RarbP22605 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RarbP22605 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RarbP22605 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RarbP22605 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RarbP22605 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RarbP22605 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RarbP22605 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RarbP22605 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RarbP22605 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RarbP22605 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RarbP22605 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RarbP22605 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RarbP22605 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RarbP22605 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RarbP22605 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RarbP22605 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RarbP22605 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RarbP22605 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RarbP22605 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RarbP22605 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RarbP22605 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RarbP22605 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms