Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn1P22387 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edn1P22387 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edn1P22387 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edn1P22387 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edn1P22387 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edn1P22387 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edn1P22387 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edn1P22387 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edn1P22387 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms