Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csn1s1P19228 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csn1s1P19228 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms