Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxb1P17919 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxb1P17919 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb1P17919 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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