Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rag1P15919 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rag1P15919 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rag1P15919 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rag1P15919 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rag1P15919 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rag1P15919 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rag1P15919 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rag1P15919 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms