Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54P14576 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp54P14576 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54P14576 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp54P14576 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54P14576 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srp54P14576 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srp54P14576 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srp54P14576 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srp54P14576 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54P14576 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54P14576 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms