Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtcP11725 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtcP11725 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtcP11725 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtcP11725 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtcP11725 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtcP11725 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtcP11725 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtcP11725 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OtcP11725 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OtcP11725 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OtcP11725 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OtcP11725 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OtcP11725 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OtcP11725 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtcP11725 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtcP11725 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtcP11725 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtcP11725 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtcP11725 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtcP11725 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtcP11725 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtcP11725 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtcP11725 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtcP11725 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtcP11725 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtcP11725 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtcP11725 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtcP11725 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtcP11725 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtcP11725 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtcP11725 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtcP11725 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
OtcP11725 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
OtcP11725 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtcP11725 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtcP11725 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OtcP11725 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OtcP11725 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtcP11725 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtcP11725 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtcP11725 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtcP11725 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OtcP11725 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OtcP11725 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtcP11725 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtcP11725 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtcP11725 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtcP11725 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtcP11725 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtcP11725 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OtcP11725 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OtcP11725 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OtcP11725 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OtcP11725 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtcP11725 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtcP11725 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtcP11725 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtcP11725 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtcP11725 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OtcP11725 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OtcP11725 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OtcP11725 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
OtcP11725 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
OtcP11725 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
OtcP11725 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OtcP11725 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
OtcP11725 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OtcP11725 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OtcP11725 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtcP11725 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtcP11725 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtcP11725 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtcP11725 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtcP11725 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtcP11725 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtcP11725 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtcP11725 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtcP11725 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtcP11725 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
OtcP11725 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtcP11725 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtcP11725 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtcP11725 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtcP11725 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtcP11725 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OtcP11725 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OtcP11725 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OtcP11725 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OtcP11725 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtcP11725 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtcP11725 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtcP11725 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtcP11725 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtcP11725 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtcP11725 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtcP11725 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtcP11725 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtcP11725 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OtcP11725 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms