Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FlgP11088 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FlgP11088 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FlgP11088 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FlgP11088 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FlgP11088 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FlgP11088 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FlgP11088 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FlgP11088 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FlgP11088 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FlgP11088 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FlgP11088 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FlgP11088 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FlgP11088 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FlgP11088 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FlgP11088 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FlgP11088 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FlgP11088 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FlgP11088 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FlgP11088 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FlgP11088 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FlgP11088 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FlgP11088 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FlgP11088 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FlgP11088 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FlgP11088 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FlgP11088 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FlgP11088 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FlgP11088 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FlgP11088 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FlgP11088 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FlgP11088 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FlgP11088 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FlgP11088 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FlgP11088 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FlgP11088 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FlgP11088 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FlgP11088 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FlgP11088 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FlgP11088 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FlgP11088 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FlgP11088 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FlgP11088 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FlgP11088 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FlgP11088 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FlgP11088 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FlgP11088 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FlgP11088 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FlgP11088 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FlgP11088 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FlgP11088 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FlgP11088 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FlgP11088 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FlgP11088 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FlgP11088 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FlgP11088 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FlgP11088 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FlgP11088 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FlgP11088 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FlgP11088 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FlgP11088 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FlgP11088 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FlgP11088 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FlgP11088 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FlgP11088 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FlgP11088 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FlgP11088 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FlgP11088 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FlgP11088 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FlgP11088 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FlgP11088 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FlgP11088 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FlgP11088 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FlgP11088 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FlgP11088 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FlgP11088 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FlgP11088 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FlgP11088 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FlgP11088 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FlgP11088 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FlgP11088 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FlgP11088 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FlgP11088 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FlgP11088 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FlgP11088 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FlgP11088 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FlgP11088 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FlgP11088 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FlgP11088 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FlgP11088 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FlgP11088 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FlgP11088 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FlgP11088 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FlgP11088 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FlgP11088 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FlgP11088 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FlgP11088 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FlgP11088 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FlgP11088 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FlgP11088 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms