Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myod1P10085 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myod1P10085 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Myod1P10085 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myod1P10085 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myod1P10085 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myod1P10085 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myod1P10085 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myod1P10085 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Myod1P10085 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myod1P10085 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Myod1P10085 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms