Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh1P09803 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh1P09803 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh1P09803 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh1P09803 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms