Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax1P09084 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax1P09084 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax1P09084 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax1P09084 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax1P09084 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax1P09084 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax1P09084 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax1P09084 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax1P09084 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax1P09084 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax1P09084 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax1P09084 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms