Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Polr2aP08775 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr2aP08775 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Polr2aP08775 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Polr2aP08775 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Polr2aP08775 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms