Protein–RNA interactions for Protein: P08414

Camk4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk4P08414 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Camk4P08414 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Camk4P08414 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Camk4P08414 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Camk4P08414 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Camk4P08414 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Camk4P08414 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Camk4P08414 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Camk4P08414 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camk4P08414 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camk4P08414 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camk4P08414 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camk4P08414 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camk4P08414 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camk4P08414 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Camk4P08414 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Camk4P08414 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Camk4P08414 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Camk4P08414 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms