Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdgfrbP05622 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfrbP05622 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfrbP05622 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfrbP05622 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms