Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prp2P05143 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prp2P05143 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prp2P05143 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prp2P05143 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prp2P05143 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prp2P05143 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prp2P05143 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prp2P05143 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prp2P05143 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prp2P05143 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prp2P05143 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms