Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GzmbP04187 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GzmbP04187 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GzmbP04187 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GzmbP04187 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GzmbP04187 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GzmbP04187 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GzmbP04187 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GzmbP04187 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GzmbP04187 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GzmbP04187 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GzmbP04187 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GzmbP04187 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GzmbP04187 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms