Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
P01678 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01678 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01678 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01678 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01678 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01678 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P01678 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01678 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01678 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
P01678 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01678 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01678 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01678 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01678 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01678 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P01678 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01678 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01678 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01678 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01678 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01678 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01678 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01678 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01678 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01678 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01678 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01678 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01678 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01678 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01678 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01678 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01678 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01678 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01678 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01678 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
P01678 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
P01678 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01678 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01678 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01678 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01678 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01678 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01678 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01678 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01678 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01678 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01678 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01678 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01678 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01678 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01678 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01678 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01678 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01678 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01678 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01678 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01678 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01678 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01678 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01678 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01678 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01678 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01678 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01678 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01678 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01678 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01678 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01678 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01678 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01678 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01678 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01678 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01678 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01678 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01678 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01678 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01678 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01678 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
P01678 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 294.5 ms