Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01667 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01667 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
P01667 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01667 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01667 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P01667 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01667 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01667 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P01667 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01667 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01667 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01667 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01667 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01667 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01667 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01667 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01667 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P01667 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01667 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
P01667 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01667 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01667 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01667 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01667 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01667 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01667 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P01667 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01667 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01667 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01667 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P01667 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01667 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01667 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01667 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
P01667 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01667 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01667 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01667 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01667 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01667 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01667 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01667 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
P01667 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01667 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01667 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01667 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P01667 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P01667 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01667 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01667 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
P01667 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01667 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01667 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01667 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01667 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01667 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01667 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01667 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01667 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01667 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01667 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01667 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
P01667 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01667 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01667 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01667 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01667 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01667 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01667 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01667 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01667 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
P01667 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01667 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01667 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01667 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01667 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01667 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01667 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01667 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01667 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01667 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01667 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01667 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01667 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01667 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01667 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01667 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01667 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01667 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01667 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01667 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01667 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01667 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01667 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01667 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01667 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01667 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01667 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P01667 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms