Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01664 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01664 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01664 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01664 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01664 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01664 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01664 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01664 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01664 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01664 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01664 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01664 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01664 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01664 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01664 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01664 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01664 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01664 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01664 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01664 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01664 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01664 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01664 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01664 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01664 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01664 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01664 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01664 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01664 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01664 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01664 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01664 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01664 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01664 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01664 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01664 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01664 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01664 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01664 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01664 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P01664 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01664 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01664 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01664 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
P01664 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01664 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01664 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01664 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01664 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01664 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01664 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01664 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01664 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01664 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
P01664 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01664 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01664 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01664 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01664 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01664 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01664 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01664 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01664 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
P01664 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01664 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01664 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
P01664 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01664 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
P01664 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01664 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01664 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01664 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01664 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01664 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01664 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01664 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01664 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
P01664 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01664 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01664 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01664 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01664 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01664 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01664 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01664 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01664 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01664 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01664 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01664 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01664 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01664 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01664 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01664 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01664 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01664 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01664 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01664 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01664 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
P01664 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms