Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnb1P01575 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ifnb1P01575 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifnb1P01575 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifnb1P01575 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms