Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc6O88978 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc6O88978 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc6O88978 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc6O88978 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms