Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AurkcO88445 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AurkcO88445 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AurkcO88445 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AurkcO88445 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AurkcO88445 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AurkcO88445 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AurkcO88445 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AurkcO88445 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AurkcO88445 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AurkcO88445 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AurkcO88445 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AurkcO88445 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AurkcO88445 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkcO88445 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkcO88445 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AurkcO88445 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkcO88445 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkcO88445 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms