Protein–RNA interactions for Protein: O70494

Sp3, Transcription factor Sp3, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp3O70494 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp3O70494 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp3O70494 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp3O70494 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp3O70494 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp3O70494 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp3O70494 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp3O70494 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp3O70494 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp3O70494 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp3O70494 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp3O70494 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp3O70494 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp3O70494 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp3O70494 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp3O70494 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp3O70494 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp3O70494 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp3O70494 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp3O70494 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp3O70494 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms