Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx3O70492 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx3O70492 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx3O70492 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx3O70492 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx3O70492 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx3O70492 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx3O70492 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx3O70492 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx3O70492 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx3O70492 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx3O70492 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx3O70492 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx3O70492 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx3O70492 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx3O70492 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms