Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmx1O70218 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hmx1O70218 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hmx1O70218 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmx1O70218 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmx1O70218 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmx1O70218 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmx1O70218 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmx1O70218 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmx1O70218 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmx1O70218 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmx1O70218 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmx1O70218 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmx1O70218 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms