Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HcrtO55241 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HcrtO55241 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HcrtO55241 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HcrtO55241 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HcrtO55241 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HcrtO55241 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HcrtO55241 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HcrtO55241 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HcrtO55241 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HcrtO55241 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
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