Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx3O55144 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx3O55144 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx3O55144 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlx3O55144 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms