Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc3O55013 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc3O55013 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Trappc3O55013 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms