Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bnip3O55003 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bnip3O55003 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Bnip3O55003 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Bnip3O55003 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms