Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LatO54957 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LatO54957 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LatO54957 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LatO54957 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LatO54957 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LatO54957 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LatO54957 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LatO54957 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LatO54957 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LatO54957 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LatO54957 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LatO54957 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LatO54957 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LatO54957 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LatO54957 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LatO54957 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LatO54957 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LatO54957 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LatO54957 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LatO54957 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LatO54957 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LatO54957 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LatO54957 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LatO54957 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LatO54957 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LatO54957 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LatO54957 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LatO54957 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LatO54957 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LatO54957 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LatO54957 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LatO54957 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LatO54957 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LatO54957 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LatO54957 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LatO54957 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LatO54957 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LatO54957 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LatO54957 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LatO54957 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LatO54957 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LatO54957 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LatO54957 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LatO54957 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LatO54957 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LatO54957 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LatO54957 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LatO54957 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LatO54957 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LatO54957 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LatO54957 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LatO54957 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LatO54957 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LatO54957 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LatO54957 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LatO54957 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LatO54957 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LatO54957 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LatO54957 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LatO54957 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LatO54957 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LatO54957 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LatO54957 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LatO54957 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LatO54957 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LatO54957 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LatO54957 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LatO54957 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LatO54957 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LatO54957 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LatO54957 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LatO54957 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LatO54957 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LatO54957 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LatO54957 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LatO54957 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LatO54957 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LatO54957 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LatO54957 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LatO54957 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LatO54957 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LatO54957 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LatO54957 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LatO54957 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LatO54957 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LatO54957 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LatO54957 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LatO54957 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LatO54957 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LatO54957 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LatO54957 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LatO54957 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LatO54957 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LatO54957 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LatO54957 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LatO54957 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LatO54957 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LatO54957 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LatO54957 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms