Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp15O54732 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mmp15O54732 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mmp15O54732 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp15O54732 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp15O54732 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms