Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccr6O54689 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr6O54689 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccr6O54689 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms