Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pik3cdO35904 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pik3cdO35904 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pik3cdO35904 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms