Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf9O35739 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf9O35739 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf9O35739 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf9O35739 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf9O35739 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf9O35739 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf9O35739 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf9O35739 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klf9O35739 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf9O35739 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms