Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Phox2bO35690 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phox2bO35690 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phox2bO35690 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms