Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RaxO35602 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RaxO35602 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RaxO35602 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RaxO35602 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RaxO35602 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RaxO35602 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaxO35602 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaxO35602 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaxO35602 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaxO35602 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaxO35602 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaxO35602 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RaxO35602 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RaxO35602 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RaxO35602 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RaxO35602 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RaxO35602 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RaxO35602 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RaxO35602 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RaxO35602 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RaxO35602 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RaxO35602 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RaxO35602 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RaxO35602 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RaxO35602 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RaxO35602 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RaxO35602 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RaxO35602 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RaxO35602 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RaxO35602 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RaxO35602 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RaxO35602 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RaxO35602 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RaxO35602 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RaxO35602 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RaxO35602 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RaxO35602 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaxO35602 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RaxO35602 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RaxO35602 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RaxO35602 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RaxO35602 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RaxO35602 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RaxO35602 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RaxO35602 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RaxO35602 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RaxO35602 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RaxO35602 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RaxO35602 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RaxO35602 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RaxO35602 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RaxO35602 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RaxO35602 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RaxO35602 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RaxO35602 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RaxO35602 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RaxO35602 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RaxO35602 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RaxO35602 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RaxO35602 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RaxO35602 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RaxO35602 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaxO35602 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaxO35602 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RaxO35602 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaxO35602 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaxO35602 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaxO35602 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaxO35602 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaxO35602 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RaxO35602 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RaxO35602 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RaxO35602 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RaxO35602 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RaxO35602 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RaxO35602 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RaxO35602 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RaxO35602 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RaxO35602 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RaxO35602 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RaxO35602 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RaxO35602 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RaxO35602 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RaxO35602 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RaxO35602 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RaxO35602 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RaxO35602 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RaxO35602 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RaxO35602 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RaxO35602 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RaxO35602 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RaxO35602 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RaxO35602 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RaxO35602 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RaxO35602 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RaxO35602 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RaxO35602 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RaxO35602 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RaxO35602 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms