Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clk2O35491 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clk2O35491 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clk2O35491 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clk2O35491 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clk2O35491 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clk2O35491 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Clk2O35491 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clk2O35491 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clk2O35491 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clk2O35491 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clk2O35491 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms