Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TnxbO35452 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnxbO35452 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnxbO35452 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnxbO35452 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnxbO35452 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TnxbO35452 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnxbO35452 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TnxbO35452 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TnxbO35452 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TnxbO35452 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnxbO35452 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnxbO35452 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnxbO35452 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TnxbO35452 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TnxbO35452 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TnxbO35452 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms