Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf2O35218 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpsf2O35218 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf2O35218 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf2O35218 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms