Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pitx3O35160 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pitx3O35160 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pitx3O35160 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms