Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc23O35125 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc23O35125 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrc23O35125 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms