Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfra2O08842 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfra2O08842 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gfra2O08842 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gfra2O08842 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfra2O08842 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms