Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tcof1O08784 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tcof1O08784 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tcof1O08784 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tcof1O08784 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tcof1O08784 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tcof1O08784 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tcof1O08784 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tcof1O08784 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tcof1O08784 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tcof1O08784 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tcof1O08784 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tcof1O08784 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tcof1O08784 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tcof1O08784 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms