Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3402K7N5P2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3402K7N5P2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3402K7N5P2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms