Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn34c2J3QNM1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34c2J3QNM1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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