Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp408H7BX78 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp408H7BX78 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp408H7BX78 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms