Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arfip1G5E8V9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfip1G5E8V9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms