Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp17ldG5E8G2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17ldG5E8G2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17ldG5E8G2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17ldG5E8G2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17ldG5E8G2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp17ldG5E8G2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp17ldG5E8G2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17ldG5E8G2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp17ldG5E8G2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp17ldG5E8G2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms