Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r34G3XA52 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r34G3XA52 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms