Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933406M09RikG3XA12 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4933406M09RikG3XA12 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
4933406M09RikG3XA12 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933406M09RikG3XA12 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms